1) Отдел контроля таможенной стоимости является структурным подразделением Астраханской таможни и подчиняется начальнику таможни и его заместителю по экономической деятельности.

2) Отдел в своей деятельности руководствуется Конституцией РФ, федеральными конституционными законами, Таможенным кодексом РФ, другими федеральными законами, указами и распоряжениями Президента РФ, постановлениями и распоряжениями Правительства РФ, иными нормативными правовыми актами в области таможенного дела, нормативными и иными правовыми актами ФТС России.

3) Методическое руководство отделом осуществляет отдел контроля таможенной стоимости Южного таможенного управления.